تخضع جميع المخطوطات المقدَّمة إلى مجلة آفاق المعرفة لعملية تحكيم علمي صارمة تعتمد نظام المراجعة المزدوجة المجهولة (Double-Blind Peer Review)، وذلك لضمان الجودة الأكاديمية، والأصالة، والنزاهة العلمية. ويُقيَّم كلّ بحث من قبل خبيرين مستقلّين على الأقل في المجال نفسه، حيث يقومان بفحص منهجيته، وإسهامه النظري، ووضوح بنائه العلمي وعرضه.

يبقى المراجعون مجهولي الهوية بالنسبة للباحثين، كما تُخفى هويات المؤلفين عن المراجعين طوال عملية التقييم. ويصدر القرار النهائي بالنشر عن هيئة التحرير استنادًا إلى توصيات المحكّمين والمعايير التحريرية للمجلة. وتنسجم هذه العملية مع أفضل الممارسات الدولية والإرشادات الأخلاقية المعتمدة في النشر العلمي.